Por otro lado, si lo que quieres es que las raíces envuelvan la roca y bajen hasta abajo a la maceta, lo que debes hacer es enterrar la roca en una maceta de plástico honda y plantar el árbol encima. Con el tiempo, las raíces crecerán alrededor de la roca. Progresivamente, irás cortando "rodajas" de un par de centímetros cada ciertos meses (según vayas viendo, tampoco lo he hecho nunca) y así poco a poco irás descubriendo las raíces, que con el contacto con las inclemencias del tiempo (sol, viento, lluvia, frío...) irán lignificando.
Más o menos así, pero con la roca debajo.
Así es como tengo entendido que se hace, y algún día yo también quiero intentar hacer uno. Espero que te haya servido de ayuda.