No veo bien la foto pero podrian ser rozaduras de las hojas en el transporte. Son muy tiernas y se dañan facilmente. Si no te aparecen mas hojas así yo no le daria mayor importancia. De todas formas abonalo y controla bien el riego
. El limon en el agua seria para bajarle el ph, pero a mi personalmente no me gusta este sistema.
Un Saludo